การกลับมาในซีซั่น 2 ของ Superman & Lois เป็นการสานต่อบทบาทเหล่านี้ พร้อมความท้าทายรอบด้านมากกว่าเดิมสำหรับครอบครัวเคนท์ เพราะหลังจากขัดขวางมอร์แกน เอดจ์ได้ สมอลล์วิลล์ก็เกิดแผ่นดินไหวประหลาดจากเหมืองที่ตั้งอยู่ในสมอลล์วิลล์ ซูเปอร์แมนเข้ามาช่วยแต่ที่นั่น เขาได้พบกับแอนเดอร์สัน เจ้าหน้าที่กระทรวงกลาโหม
ผู้ทำหน้าที่แทนนายพลแซม เลน (พ่อของโลอิส ซึ่งเกษียณราชการเมื่อตอนจบซีซ่น 1) ที่ส่งยอดมนุษย์จากการทดลองมนุษย์ธรรมดาให้มีพลังเหมือนซูเปอร์แมนจากโครงการ Supermen of America มาควบคุมสถานการณ์ และนับจากเหตุการณ์แผ่นดินไหวนั้นส่งผลกระทบบางอย่างต่อซูเปอร์แมน ทำให้เขาปวดหัวขาดสติชนิดหาสาเหตุไม่ได้ จนเห็นนิมิตประหลาดในเวลาต่อมา นี่เป็นเพียงจุดเริ่มต้นพาพวกเราผู้ชมไปสู่ความดราม่าเข้มข้นใหม่ๆ
ความตึงเครียดและภัยคุกคามใหม่ในซีซั่น 2 ตามสไตล์ซีรีย์ฮอลลีวู้ดมักสร้างปมให้แต่ละตัวละครเผชิญปัญหาของตัวเอง จึงทำให้เส้นเรื่องมีมากกว่าหนึ่ง และในซีซั่นนี้มีผู้ร้ายหลายคน และวายร้ายทั้งสองส่งผลกระทบต่อคลาร์กและโลอิสเป็นการส่วนตัว เริ่มต้นด้วยวายร้ายคนหนึ่งที่เป็นซูเปอร์แมนจริงๆ ขณะที่วายร้ายอีกคนส่งผลต่อโลอิส นั่นทำให้ซีซั่นนี้แตกต่างไปจากปีที่แล้ว
